最后美軍戰機被打的落花流水，事實證明，敵我實力懸殊太大，硬碰硬顯然不可行，無奈之下只能撤退。但是外星戰機窮追不舍，非要把美軍趕盡殺絕。最后，這支精英編隊就只剩下上位一個人了，他逃到了內華達沙漠中的狹小山，憑借出色的飛行技巧以及冷靜的判斷，躲過了一次又一次的致命攻擊。就在飛機燃油耗盡的時候，他及時打開降落傘逃出升天。而外星戰機因為視野被遮擋而撞上山坡墜毀，尚未爬起來，憤怒的走向外星戰機，并打開了對方的艙門。只見一個滿身觸手的怪家伙，正罵罵咧咧的往外爬。

史密斯尚未毫不客氣的一拳把他打暈了，然后將他放在降落傘中打包好，拖著他往基地的方向走去。在他們艱難的走了一段路口，遇到逃難的車隊，尚未攔下了一臺車一起趕往基地。與此同時，總統一行人也到達了這個隱藏在內華達州的51區基地。

當他們下降到地下24層之后，終于看到了這座神秘基地的陣容。總統很生氣，這個國家竟然還有瞞著他的秘密。

基地的負責人帶他們參觀了1947年在羅斯維爾事件中獲得的飛船，以及被做成標本的外星人。根據奧肯博士的介紹得知，外星人的本體其實不堪一擊，但他們的盔甲堅硬無比。而且更加神奇的是，外星人都是用腦電波進行交流。

因為大衛成功破解過外星飛船的信號，所以總統決定讓他研究這架飛船，看看能否找到外星人的弱點。這時，史密斯上尉也帶著外星人來到了秘密基地。守門的士兵起初還不讓他們進入，但是史密斯亮出了他的戰利品后，嚇得士兵趕緊對他們放行了。

外星人被帶進來后，奧肯博士馬上開始了手術研究，他們發現這個外星人身穿一層盔甲，剛剛脫下他的盔甲。外星人醒了過來，立刻做出反應，嚇得眾人連連后腿。就在博士還想繼續解剖時，外星人用腦電波損壞了儀器設備。

還殺死了博士的同時，這時總統趕來，正好看到了這一幕，外星人趁機控制博士的身體，發出聲音，要求總統馬上放了他。而總統還幻想著跟他們和平共處，可外星人卻說，地球人必須全部殺光，還發出刺耳的聲波，襲擊了總統，總統的頭，感覺要炸開了一樣，倒地不起。

將軍見狀，立刻掏出手槍擊斃了外星人總統，這才恢覆了正常。同時他也知道了外星人的計劃，他們像蝗蟲一樣到不同星球去掠奪資源。

這次的目標是地球，他們早就派出過偵察飛船來過地球，對我們的一切都了如指掌，其中一些偵察飛船還墜毀在地球，被人類撿到了。

如果這次外星人侵略成功，地球將失去所有生命。將軍希望使用核武器摧毀敵人總統之前一直猶豫不決，因為他不想在自己的國土上使用核武器，但現在已經沒有其他辦法，只好同意飛行中隊全副武裝，帶著核彈出發。在他們發射完核彈后，親眼看到核彈貼著飛船爆炸。

大家正比歡呼。然而不一會兒，收到觀察者的消息，外星飛船依然完好無損，地球最強的武器竟然都無法傷害敵人，所有人都感覺到了絕望。這時大衛已經破解了外星人飛船的系統，但這并不能對敵人造成損傷，他感到很無力。

父親不忍心看到兒子，這樣，他勸兒子註意身體，小心生病。這話突然點醒了大衛，他要讓敵人的飛船生病，大衛立馬召集了工作人員開始試驗，他讓士兵對著飛船上的可樂罐開一槍。結果由于受到防護罩的保護，可樂罐安然無恙。

然后大衛將自己寫好的電腦病毒上傳到了飛船上，讓士兵再次射擊，結果可樂罐直接被打飛了，飛船的護盾竟然消失了。大家都非常吃驚，大衛馬上說出了自己的計劃，他要將病毒上傳到外星人的母船裏，只要母船重力病毒就會傳播給其他飛船，這樣就會同時解除他們的護盾，然后地球人的武器就可以殺死他們。

史密斯尚未自告奮勇，他要駕駛這架墜毀的小飛船登陸外星女船。去植入病毒，總統同意了這個計劃，并將計劃用摩斯電碼發送給了全世界，號召所有國家的空軍一起發起反擊。所有的國家放棄了曾經的仇恨，空前的團結起來，一起對付外星人。

這一天正是美國的國慶日。總統在出發前發表了一場振奮人心的演講。由于之前的戰斗，空軍損失殆盡，飛行員出身的總統最后也親自上陣，準備和外星人拼的尼斯。我另一邊大衛和史密斯一起登上了外星飛船，駕駛著他飛向了太空中的母艦。

當他們接近母艦的時候，正好看見外星人大軍已經集結完畢，準備對地球洗劫一空。小飛船飛進母艦后，開始了自動對接，大衛找準時機，當即植入了病毒，同一時間，由總統帶領的空軍也開始行動。他們先嘗試著發射了一枚導彈，結果卻發現飛船的防護罩還在，大家都以為病毒植入的計劃失敗，于是全都掉頭返回。但總統不甘心，決定再試一次。

第二枚導彈發射后，竟然成功的在外星飛船上爆炸，護盾真的消失了，眾人歡呼，戰機全部返回，導彈傾瀉而出，外星飛船瞬間被炸開了花，趕緊放出了小飛船出來攔截，但是小飛船此時也沒有了護盾，保護這次可以公平較量了。

一時間，天空中火花4起，就在空軍打的正起勁兒的時候，導彈竟然消耗光了。然而外星飛船卻還沒有什么大的損傷，現在戰機需要盡快返回補充彈藥。

外星飛船此時又在聚集能量，準備發動能量攻擊，總統將僅有的一顆導彈打出去，卻沒有擊中要害。眼看外星飛船的能量聚集，就要完成了，一位老飛行員駕駛著戰機沖向了發射。而這裏正是外星飛船的要害。隨著一陣劇烈的爆炸，外星飛船被徹底摧毀了，反擊戰大獲全勝。

而這是在外太空的大衛和史密斯把一顆核彈留在了外星人母艦裏面。然后兩個人驚險的逃了出來。核彈在母艦中爆炸，巨大的飛船瞬間化成無數的碎塊，瞬間吞沒了史密斯。

他們的小飛船。幸好小飛船足夠結實，順利的飛了回來，二位英雄也平安的降落了地球。這場地球保衛戰，人類終于取得了勝利。那么外星人到底來自哪裏？他們會善罷甘休嗎？