這一天，四月二十二，交戰之時起了大風，飛沙走石，十分猛烈。吳三桂的軍隊是聯軍的右翼，首先大聲喊殺，對敵攻擊，將李自成的陣尾搖動；接著多爾袞令清軍騎兵猛沖。李自成的兵一向仗著人多，嚇退明朝的一些以敷衍為能事的文武官僚與領不足餉、吃不飽飯、拿不動刀槍的花子兵，從來不曾見到清兵，今日一見，如此身材魁梧，衣甲整齊，槍長刀大，坐下的馬又是個個驃肥腿快，結果，全軍崩潰，當天一奔就奔了四十里。

多爾袞與吳三桂緊追，追到永平，李自成向吳三桂求和。吳三桂要他交出崇禎皇帝的太子朱慈烺與三太子定王朱慈炯、四太子朱慈燦。李自成照辦，吳三桂卻設了埋伏，弄得李自成又敗了一仗。

李自成逃同北京，燒了宮殿，向南走。吳三桂準備送崇禎的太子入京即位，多爾袞不旨，叫吳三桂也向南走，去追李自成。吳三桂去了，多爾袞卻把清軍開進北京，加以占領。

吳三桂追擊李自成，打一次勝一次，追到真定(清朝改為正定)，李自成經由娘子關旁的故關，遁入山西。吳三桂回師北京，看多爾袞已經收降明朝的大小官吏，成立了新的朝廷，而且不久便封他為“平西王”，也就不再說什么了。

李自成遁入山西，多爾袞派鑲紅旗的固山額真葉臣去追趕。這李自成聽信他丞相牛金星的讒言，殺掉左右之中最有政治遠見的李巖(原名李信，河南杞縣舉人，曾經因散糧救濟貧民而入獄，后投奔自成)。李巖被殺以后，李自成的團體無形中瓦解，從此不堪一擊。山西全部入于葉臣及降清的巡撫馬國柱之手。李自成逃回陜西。

多爾袞又派遣多鐸與阿濟格二人，分別由東路北路夾攻，多鐸帶了索渾、圖賴、阿山等人的女真兵作為前鋒，以毛文龍舊部孔有德的兵作為后援，攻打潼關。守潼關的是當年在北京擄了陳圓圓的劉宗敏(陳圓圓到了真定，被吳三桂搶回)。劉宗敏守不住潼關；李自成來救，也被清軍打敗。潼關入于多鐸之手。同時，阿濟格率領吳三桂與毛文龍的另一舊部尚科喜，已由大同榆林進入陜北，占了李自成的故鄉，威脅李自成的都城西安。

這一個國號大順、年號永昌、在崇禎十七年(1644年)四月匆匆忙忙即位于北京的皇帝，丟了他的都城，出武關，向襄陽逃去，改以襄陽為都，取名“襄京”。不久，明朝的雄踞武昌的左良玉，率軍東下，要到南京去“清君側”，和福王朱由崧的左右拼命，武昌成為空城。李自成也就樂得跟踵而來，拿了武昌。

阿濟格在他的后面窮追，追到武昌城邊，李自成于是奔到九江，又由九江奔去通山縣的九宮山，在九宮山扎下大營。

有一天，李自成異想天開，單槍獨馬，跑到玄帝廟去燒香，也許是為了求簽。他少年時候當過驛站的站夫，又當過殺豬的屠戶，有江湖術士告訴他“必為天子”，這才投到舅舅高迎樣那里。現今天子算當成了，卻遇到韃子對頭，所以，求求簽，問個前程也好。然而老百姓看到他那瞎了一只眼的樣子，就不分青紅皂白，刀棍鋤頭齊下，把他殺了，殺得血肉模糊。殺了以后，剝開外農，看見內衣上繡的有龍，懷中又有金印一顆，才知道原來是他。

李自成留下的隊伍五十余萬，其中一部分于郝搖旗、李過、高一功等人的率領之下，開到湖南，想搶長沙，被湖廣總督何騰蛟說動，情愿效忠明朝。何騰蛟把郝搖旗的名字改為郝永忠，李過的名字改為李赤心。李過是李自成的過房兒子，李自成本人無子。高一功改為高必正；高必正的姐姐是李自成的“皇后”，也投了降，被隆武皇帝(唐王)賜名為“忠義走人”。

多爾袞在阿濟格打平李自成，班師回朝之時，特地坐在“午門”，盛設儀仗，當眾斥責他一頓：說他不該未奉旨令，擅自班師，又不該未知李自成確實已死，就謊報李自成的死訊。阿濟格低頭認罪，多爾袞把他由親王降為郡王。

過了一些時候，多爾袞重新把他由郡王升為親王。這一降一升之間，可以見到多爾袞駕馭全朝文武的手段：恩威并施，變化莫測。

李自成既死，剩下尚有張獻忠、多爾袞不派別人去打，卻偏要派豪格。豪格已在順治元年(1644年)正月間被廢為庶人，多爾袞又在十月間把他再封為肅親王，并且加了“和碩”二字(和碩”的意思，是“大”)。

順清三年(1646年)正月，多爾袞發表豪格為“靖遠大將軍”，叫他帶領多羅衍禧郡王羅洛宏、貝勒尼堪、貝子屯齊喀、滿達海，去肅清陜西(包括今天的甘肅)的群“盜”與四川的張獻忠。豪格欣然就道。

這時候，張獻忠據有四川全境(秦良玉的石硅除外)，力量相當雄厚。豪格花了幾個月工夫，先把陜甘群“盜”一一予以消滅或招安，到了十一月間便移軍漢中，準備入川，找張獻忠打。恰好有一個劉進忠，原是張獻忠的川軍頭目聽說張獻忠就要把他自己和所帶的川軍，一齊抓去屠殺，便著了慌，跑到漢中來向豪格投降。

豪格把他的川軍編為先鋒，向四川進發，替大批的“滿洲兵”開路。

張獻忠本已把成都定為“大西國”的京城，卻不耐煩在成都久住。他燒了成都宮殿，把軍隊向北移動，頗想打進陜西，返回老家。

捌進忠引清軍進來。一直開到劍閣以南的鹽亭縣，如入無人之境，在鹽亭與西充之間的鳳凰坡，遇到了張獻忠。張獻忠還以為有劉進忠替他守住川北，清軍無論如何進不了四川。