他有沒有在廣州加入天地會，頗難查考。倘若有，可能是在這個時候。
馮云山不曾隨他來廣州，也不曾隨他回花縣。馮云山一直留在廣西，活動于貴縣、桂平縣、武宣縣一帶，為三千多人洗禮，組織成一個“拜上帝會”。
“拜上帝會”的總部設在桂平縣境的紫荊山。這山山后與瑤山相連，山前與金田村鄰近。
洪秀全在道光二十七年(1847年)的七月十五口，來到紫荊山：與馮云山相聚，被馮云山奉為拜上帝會的教主，尊稱為“洪先生”。他單獨住在一個地方，不輕易與眾會友接近。
洪秀全在紫荊山只做了一件露面的事：于道光二十七年九月間率領馮云山等幾個人去象州甘王廟，把神像毀了，在墻壁上寫了“甘妖”的十大罪狀。
如此作風，誠然侵犯了別人的信仰自由，卻鍛煉了一般會友的戰斗性，加強了內部的團結。
當地的地方官以為拜上帝會與洋人的天主教是一回事，對于拜上帝會的種種活動，便裝聾作啞不加取締。會友們越鬧越兇，引起公憤，有一個秀才王作新出面向桂平縣的縣知事告馮云山一狀。縣知事本想不管，抵不住王秀才的一再堅持，只得在十二月十二日那一天將馮云山捉了，關在牢里。
洪秀全這時不在桂平而在貴縣(住在他的表哥家里)，聽到消息就來到紫荊山設法，卻也想不出什么辦法。他回廣東花縣籌募款項，準備給桂平縣知事送紅包。然而他在花縣籌不出款項來，于是又去廣西，到紫荊山。
這一邊，馮云山被關了兩個多月，已由縣知事從寬發落，于道光二十八年三月初三日判令押解回籍。
押解馮云山的衙役，在途中與馮云山談話，聽到馮云山的一番大道理，例如上帝創造宇宙，蛇魔騙亞當偷吃蘋果，耶穌為亞當子孫贖罪，洪教主是耶穌的兄弟......等等，衙役聞所未聞，十分佩服，就不但放了馮云山，而且跟隨馮云山去紫荊山入會。在山上，馮云山聽說洪秀全已回花縣，于是趕忙也回花縣。到了花縣，才知道洪秀全又去紫荊山，只好姑且留在花縣，候洪秀壘再回花縣來。
果然，洪秀全于撲了一個空以后，在紫荊山等候到十月，就回花縣來了。次年，道光二十九年五月間，兩人最后一次結伴去廣西，上山。
山上的情形，已經與他們離開之時迥不相同。楊秀清于他們缺席的期間，作了事實上的領袖。
這楊秀清是桂平的一個土豪，以“種山”燒炭為生，為人詭計多端，野心頗大。參加拜上帝會以后，他介紹了不少的新會友進會。在道光二十八年三月初三(也就是馮云山被縣知事判令押解回籍的一天)，也在山上裝做人事不知、口吐白沫、說起胡話來，自稱是“上帝下凡”，指出幾個會友的秘密，加以責備。會友們信以為真。從此，楊秀清就作了上帝耶和華的代言人。
洪、馮二人來了以后，不便拆穿楊秀清的戲法，只得加以承認，其后在太平天國的圣歷中并且規定了三月初三日為“爺降節”。
拜上帝會的另一活動分子蕭朝貴，也在這一年(道光二十八年)九月初九日如法炮制一番，自稱“天兄下凡”。洪、馮照樣追認，于是九月初九日在圣歷中成為“哥降節”。
蕭朝貴原是楊秀清的親戚。他與楊秀清如此合作演出雙簧，使得洪、馮二人十分擔心。
洪、馮二人計議了若干時日，把洪秀全的妹妹洪宣嬌嫁給蕭朝貴，爭取蕭朝貴，藉以制衡楊秀清的勢力；又把馮云山的第二把交椅讓給楊秀清，藉以穩住楊秀清的心。
作為拜上帝會的核心領導集團共有六人：洪秀全、馮云山、楊秀清、蕭朝貴、韋志正(昌輝)、石達開。這六人結盟為兄弟，遙奉耶穌為長兄，以洪秀全為次兄，馮云山為三弟，楊秀清為四弟，蕭朝貴為五弟，韋昌輝為六弟，石達開為七弟。洪秀全常稱石達開為“達胞”，原因在此。
六人之中，馮與洪為中表兼曾同學，又同為創教立會之人，關系最密。楊、蕭二人，皆是桂平的燒炭“工頭”。韋、石二人籍貫不同，韋是桂平縣人，石是貴縣人，但兩人均出身富家，韋是金田村的大地主，石則略通文墨，是本縣客家人之中的首領。
地位僅次于這六人的是礦工頭目秦日綱，此人其后作了太平天國的若干丞相之一。同屬于丞相一級的，又有胡以晃、賴漢英、蒙得恩、林鳳祥、李開芳等人。
拜上帝會的人數，早巳由三千余人擴充到一萬以上；勢力也不僅限于紫荊山的周圍，而遠及于平南、陸川、博白、武宣、象州、藤縣等若干州縣了。
為了積極作造反準備，拜上帝會的會友以“自衛御盜”作為口號，買武器、制軍裝，經常操練。
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