警部；緝拿匪盜，維持治安。
六扇門；主要負責鎮壓江湖的不法之士。
檢察院；負責清查不法官吏，交由法院審判。
檢察院原本的吏部被劃走，又把法院旗下的警部、六扇門劃歸檢察院管理。以后檢查院就專司清查漢軍治下不法之事。
政務院下分為；縱橫部、民部、工部、禮部、國土部、商部，兵部、吏部、
縱橫部；負責漢軍的對外事宜。
民部；負責編戶齊民。
禮部；負責禮儀祭祀，開設書院。
國土部；負責收歸土地，掌控礦山林木資源。
商部；負責民間商業往來。
兵部；負責招募兵源，以及退伍士卒的安置。
吏部；負責官員升遷的調查批復。
政務院變化不大，不過倒是把吏部重新劃歸政務院，不過政務院的各部部長皆有面君之權，而且，玄陽還規定，州府以上官員任命必須經過玄陽批準。
樞密院這邊倒是變化極大。警衛軍也被玄陽徹底的從兵部手中拿走，歸入樞密院。
樞密院下組建了參謀部、教習部、后勤部，警衛部、軍事法院、軍校等。
玄陽還正式把漢軍分為御林軍、漢軍、警衛軍三類。
御林軍：一軍三師編制，總共十五萬人。
漢軍：十師編制，總共四十萬人。
警衛軍：則是根據政務院的行政規劃，州-府-縣-鄉-村的五級行政制度。
警衛軍每州駐守一旅兩團，16000士卒。
每府駐守一團8000士卒.
每縣駐守一連300士卒。
至于鄉和村倒是用不上警衛軍出動，交給警部就好了。一旦警部遇到無法處理的情況，可以向警衛軍求援。
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