想通了這一點，石英鐘立馬直起身子，大聲對著門外叫道：“來人！“
“有！“一名士兵走了進來敬禮道。
“今天幾號？“石英鐘嚴肅的問道。
“三月十二號，司令閣下！“
就是今天！石英鐘心里一驚，快速地走了出去，邊走邊對那名士兵道：“傳令部隊馬上集結，傍晚之前，艦隊離開京都灣，目的地--北海道。“
咸豐二十八年三月十二日，大清帝國的九州艦隊離開京都灣，德川幕府對此雖然感到莫名不已，但是海上有了大清帝國的海軍，德川慶喜很放心。他敢肯定尊王派的那幾條破戰艦短時間內是不敢再出現在京都附近了。
為了挽回幕府軍的損失以及，解除就都一帶的尊王派的威脅，德川幕府第二天組織了一次大規模的反攻。幕府在這段時間內用盡了一切辦法，集結了十五萬大軍，利用大清帝國支援過來的各種武器，將這十五萬日本農夫小販運上了戰場。
由于得知了大清帝國正在向幕府派出援軍，明治天皇在還沒有得到美國政府的確切答復之前，不敢有下一步的動作，這給了幕府大軍一個天大的機會。二十多萬包圍在京都附近的叛軍被突然沖出來的幕府大軍打了個措手不及，整個防線撤退了五十公里才算穩定住。
幕府大軍大部都是一些沒有經過訓練的平民，根本不懂得打仗，在叛軍撤退的時候沒有快速地抓住機會反起追擊，擴大戰果，致使雖然京都附近的危機解除，便卻沒有對叛軍的實力造成多大的影響。
咸豐二十八年三月十四日，大清帝國的龐大海軍艦隊抵達日本京都灣海域。一抵達日本，大清艦隊總指揮余永航都發下了通告，希望明治天皇停止對幕府的攻擊，大清帝國只且僅承認德川幕府為日本的唯一合法政府。若明治天皇再不停止這種行為，大清帝國將似其為對亞盟的挑釁，給予嚴懲。
此時美國國會正在一片熱吵當中。美國國會議員分成了三大派。其中大部狂熱的議會認為此時是美國占領日本的最佳時機，不應該向大清帝國妥協。而與其相對的一派則是一些由美國猶太人家族支持起來的議員，他們認為美國與大清有過多年的合作經歷，在歐洲大戰還沒有結果之前，美國不應該將自己拖入與大清的戰爭泥潭之中。這派的人數雖然少了一些，但卻是許多美國公民所認同的看法。
而另一派人數也不在少數的議員則認為，美國的重心不在太平洋，沒有必要為了一個毫無意義的日本，而與大清帝國結下過節。現在美國最重的事情是關注歐洲戰爭的發展進程，抓住機會，進軍歐洲。
就這樣，吵鬧了三天之后，美國國會最終還是以多數票數通過了對日本進行干涉。就在大清帝國海軍到達日本的同一天，美國國會向大清政府發出了召會，認為日本的內戰是日本本國的政治問題，大清帝國沒有理由干涉。
同時，美國的太平洋艦隊以及一部的大西洋艦隊開始向日本海域出發。到大清帝國對明治政府進行有目的的海面封鎖之時，大清帝國的海軍部隊已經與美國太平洋艦隊有過多次的短距離對峙了。
有了美國政府的行支支持，明治天皇心里有了主心骨。他于三月底再次組織起一次大規模的進攻，將幕府大軍再次趕回了城里。幕府苦心組建的十五萬大軍，等到撤回去的時候，僅僅只余下了不到一半，這其中大部分的士兵都是在戰場之上，叛軍還沒有打過來，便抱頭逃跑了，另外一些人，干脆就是帶著部下投降了叛軍。
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