在四川周圍，大明實際上有兩支軍隊存在。
除了新川軍之外，還有王應熊、樊一蘅率領的原四川駐軍，他們的人數要遠遠多于新川軍。其中直接指揮軍隊的是楊展和曾英。
由于新川軍的建立，原本的夔東十三家就已經不復存在了，但是遵義的王應熊卻對呂大器和秦良玉不感冒，他根本就不打算奉詔接受秦良玉的領導。新川軍甚至和曾英的手下在涪陵發生過沖突。
川陜總督樊一蘅加上一個崇禎六年的禮部尚書兼東閣大學士，他們在遵義（當時遵義屬四川管轄）拉起隊伍風風火火的和張獻忠對著干，誰也不服調遣。
呂大器躲在昆明無所作為，只能協助沐天波維持云南一直不敢去遵義上任。要不是朱由檢派了兩萬人來石柱，恐怕王應熊他們還有搶奪秦良玉兵權的可能。
曾英的手下是原蜀地的潰軍，而楊展則是自己拉起的地主武裝。這二人目前勢頭正盛，沿江占有所有川地，已經開始朝嘉定（今四川樂山）『逼』近。
朱由檢想收他們的兵權？心里只能呵呵想想了。把后金的部隊和沐天波的土司軍隊算上，現在的西南以四川為中心，聚集了近八十萬軍隊，形成了四方勢力在爭奪。朱由檢的新川軍是兵力最少的那一方。所有對手總兵力加起來是他的十倍不止。
后金阿濟格部現有軍力近十五萬，吳三桂兵十萬；張獻忠有兵三十萬；楊展率兵五萬，曾英、李占春與于大海合兵十萬；沐天波也有五萬人。加起來接近八十萬人馬。
此局難度遠遠超過之前的江北四鎮的格局，而且朱由檢基本上只有沐天波一個幫手和王應熊、樊一蘅等人心懷不軌的表面派。
“水師，必須要水師入川。”朱由檢盯著地圖，思索著應對之法。
要想水師進三峽，最好是冬季的枯水季節。瞿塘峽口的滟澦堆，是一塊橫臥江心的巨大的礁石長約機米寬約5米鎖住長江航道，枯水季節，『露』出江面達加余米，夏季水漲，滟預堆潛伏水中更加危險，自古以來船家視為畏途，稍有不慎就會船毀人亡葬身魚腹。
只有在枯水季節，許多暗礁才會『露』出水面，核心的航道才能行船。
船只上行，靠的是人力拉纖，風帆起得作用反而不大。從夷陵到奉節全長一百二十余里，三峽中，西陵峽最長，這里航道曲折、怪石林立，水流至此突然變得處處都是急流、險灘，這里有西陵峽有“三灘”——泄灘、青灘、崆嶺灘，還有“四峽”——燈影峽、黃牛峽、牛肝馬肺峽和兵書寶劍峽。在長江航線上，流傳著這樣幾句話：“西陵峽中行節稠，灘灘都是鬼見愁”。
千百年來，三峽航道的沉船不知多少，朱由檢在后世曾經親眼見過三峽大壩壩基抽干水之后『露』出一個沉船，里面埋進去了非常多的唐代銅錢。
“皇上，水師入川最少需要兩個月，來得及嗎？”川軍司令部，左懋第現在比較清閑，他手下有一大幫的參謀正在整理各種情報，倒是不像以前那么辛苦了。
“讓夷陵的船先進來，武昌的再跟上，九江的船也能在一個月內趕到。只要有五十艘戰場橫在江面，咱們就不會被動了。我親自去奉節請老船工去。”
川內水系也是四通八達，岷江、沱江、嘉陵江，不管朝哪個方向調兵，有了水師的協助要事半功倍的多。
還有一個原因朱由檢沒說，那就是水師從嘉陵江北上，趕到南充是阻擊后金最近的路線。至于成都，朱由檢得到的情報是已經被張獻忠禍禍得差不多了。
“那我這邊趕緊派人去探查重慶的情況，咱們必須先拿下重慶才能進嘉陵江。”左懋第聽朱由檢都要親自去奉節了，他哪里還敢安坐在司令部里享福。
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