當支援艦隊輾轉至圣多明各（今臺灣淡水）時，遇到了鄭芝龍數十艘組成的移民船隊，隨即展開了激烈的海上搏殺。雖然，西班牙人憑借船只巨大，火力兇猛，擊沉擊傷了十余艘大小船只，但更多的鄭家船隊還是逃入了圣多明各。并且，依靠岸邊的炮臺，挫敗了西班牙人的登陸企圖。

眼見著西班牙在島上的兩處據點均被攻占，支援艦隊所攜帶的武裝也無力奪回，而且還要擔心，對面大陸上的明國海軍的援兵趕來，卡洛斯·巴特雷斯少校只能率領艦隊返回馬尼拉。

科奎拉總督對失去福爾摩沙殖民據點正在感到萬分惱怒的時候，從卡拉巴又傳來一個更為嚴重的壞消息，卡蘭巴屯墾區的明人發動了暴亂，他們擊殺了前來收糧的一百多名殖民軍，還趁勢攻占了卡蘭巴城。

據圣佩德羅城的官員匯報，多達數千人的明人，持有刀劍和木矛蜂擁地沖進了卡蘭巴城，他們殺死了內湖省高官、卡蘭巴計劃監督官路易斯·a·莫拉及以下數十名西班牙官員，并斃傷俘虜了幾乎所有的西班牙士兵和土人仆從。

僥幸逃出卡蘭巴城的零星官員和士兵不敢走大路，而是順著林間的小路，繞道往馬尼拉逃亡。經過大半天的亡命奔逃，直到進入圣佩德羅城，才稍稍喘口氣。

圣佩德羅城的守軍迅速集結了兩百人的部隊，二十多個胸甲騎兵為前鋒，火槍兵和土人仆從在后，準備往卡蘭巴城平定明人的暴動。

卻不料，在半路上，遭到暴動明人的埋伏。二十多個胸甲騎兵，被一陣排槍射殺十余個，然后公路兩邊的林中涌出千余手持刀劍長矛的明人，將西班牙平叛部隊迅速圍殺在路上。只有五六個騎兵借著馬速逃了出來。

圣佩德羅城頓時震動不已，立刻全城動員，并派人向馬尼拉總督府報信。

科奎拉總督聽到卡蘭巴屯墾區明人暴動的消息，臉色變得非常難看。而且還聽聞，暴動的明人居然持有大量刀劍長矛，甚至還擁有火槍。這樣一來，事態就非常嚴重了，甚至比丟失福爾摩沙兩個殖民據點還要嚴重。

數千明人，占據了卡蘭巴城，還擁有武備力量，這對整個菲律賓的安全構成了直接的威脅。不要忘了，城外的八連（馬尼拉城外華人聚居區），還聚集著一萬多明人，再加上菲律賓其他地方的明人，要是一起響應卡蘭巴暴動明人的行動。那對整個菲律賓的西班牙人來說，無異于滅頂之災。

“城外的明人有什么動靜？”科奎拉總督有些緊張地問道。

“還沒有任何異動?！标戃娝玖畈桚R?奧納托上校也是神色嚴峻，鄭重地說道：“我已經下令關閉馬尼拉所有的城門，并命令城頭的炮手，一旦八連的明人有任何不軌行為，立即開炮。另外，城內的部分明人，也已經控制住了，全部關押在軍營里?！?

“你的應對非常正確，也非常及時。”科奎拉總督點頭說道：“我們還要封閉港口，禁止明人商船到港。那些還未離去的明人船只，全部予以扣押。哦，上帝，這是怎么了，簡直是一團糟！”

馬尼拉殖民官員們看到總督大人在面對目前嚴峻的形勢下，表現的有些失態，不禁面面相覷，心里也跟著有些緊張起來。

“總督大人，巴達維亞的荷蘭代表已經來市政廳詢問過我們多次了，何時簽署一份新的停戰合約。……我們是否立刻同意他們的要求？”海軍司令羅爾?沙伊特上校小心地問道。

“嗯？”科奎拉總督凝神想了一下，隨后點頭說道：“答應他們的要求，簽訂一份新的停戰合約。還有，要封鎖我們這里的消息，不能讓他們知道這里發生的一切?！?

“遵命，總督大人?！绷_爾?沙伊特上校說道：“在荷蘭人離開之前，我會派人全程陪同他們。”

“總督大人，我們需要……動員武裝力量去卡蘭巴嗎？”波爾齊?奧納托上校問道：“他們此時，應該還未徹底掌控那里的一切，我認為，必須派出一支有力的武裝去給予他們沉重的打擊?！?

“我們需要派出多少部隊？我們馬尼拉城里還有多少人？”科奎拉總督有些惱怒地看著奧納托上校，“你準備將一座空虛的馬尼拉城丟給八連的明人嗎？……派出信使，去墨西哥求援吧?！?

眾人聞言，齊齊地看著科奎拉總督，去墨西哥求援，一來一回，再加上準備時間，快的話，一年半時間，慢的話，估計要兩年了。

這么長時間，只有上帝才知道，菲律賓的局勢會發展到何種地步！以科奎拉總督的意思，菲律賓殖民政府緊守馬尼拉，其他地方可以置之不顧了。

科奎拉總督的決定，也是出于無奈之舉。這三年來，西班牙人損失了太多的人，與漢洲的戰爭，與荷蘭人的戰爭，以及在福爾摩沙的損失，前前后后，有一千多人，如果加上土人仆從的話，那損失的更多。

這幾年，一直被上帝眷顧的西班牙人似乎被它拋棄了，不論是在歐洲，還是美洲，乃至在遠東，都遭受了全面挫折。