藍(lán)朝柱起義軍也已由四川進(jìn)入漢中全陜震動陜西巡撫瑛棨和團(tuán)練大臣張芾慌忙調(diào)集各地團(tuán)練往南山堵御太平軍

太平軍入陜當(dāng)年5月訓(xùn)導(dǎo)趙權(quán)中所屬團(tuán)練中數(shù)百名回勇不愿和太平軍作戰(zhàn)殺死帶隊官避居城外秦家村將秦家村及附近回民村莊搶劫一空又四處散發(fā)“陜西不留回民天意滅回”傳帖

華州回民首先起義渭河兩岸回民爭相響應(yīng)未經(jīng)旬日各處回民俱行激變從此聲勢浩大陜西回民起義迅速發(fā)展起來

面對迅速發(fā)展回民起義以巡撫瑛棨為首陜西文武官員“籌剿無兵”“不能不暫行撫慰”派遣官紳分赴各地安撫張芾等臨潼油坊街和回民談判時回民甚為氣憤將他押往倉頭鎮(zhèn)處死

回民起義烽火迅速遍及八百里秦川起義隊伍擴(kuò)大至二十余萬當(dāng)時陜西回軍主要首領(lǐng)除任武、洪興、赫明堂外還有馬正和、馬四元、白彥虎、馬生彥、禹得彥、余彥祿、孫玉寶、二河州等其中有是富甲一方地主、商人和阿訇等上層分子起義軍領(lǐng)導(dǎo)權(quán)掌握他們手中

陜西回民起義迅速發(fā)展嚴(yán)重威脅到清王朝西北統(tǒng)治清廷急令荊州將軍多隆阿率軍入陜1863年1月中多隆阿率部由河南入陜連同勝保諸部共有兵二萬余人

9月初多隆阿到達(dá)西安施展招撫伎倆派人到回民起義軍中誘降利用西安城中回紳頻繁回民軍首領(lǐng)中進(jìn)行招撫活動孫玉寶等向清軍投降

白彥虎、馬生彥、禹得彥、余彥祿率部向西北經(jīng)醴泉、乾州退至邠州其后回民起義軍大部退至隴東董志原其他回民軍也赫明堂等率領(lǐng)下經(jīng)武功、郿縣、鳳翔、隴州進(jìn)入甘肅東部地區(qū)從此陜甘回民起義中心由陜西轉(zhuǎn)到甘肅

大清統(tǒng)治者驚呼：“現(xiàn)甘肅之平?jīng)?、靜寧、隆德、安定省南之鞏昌、秦州、伏羌、清水省北之寧夏、平羅、靈州、固原莫不揭竿而起蜂屯蟻聚滋蔓難圖綿延地方數(shù)千里”

多隆阿準(zhǔn)備由秦度隴鎮(zhèn)壓甘肅回民起義他為了解除西征時后顧之憂企圖迅速攻下由藍(lán)朝柱起義軍固守陜西盩厔3月3日多隆阿親自指揮攻城時為起義軍擊傷頭部不久死去清軍喪失了主帥不能銳意西進(jìn)

1864年5月、6月間清王朝調(diào)福建水師提督楊岳斌充任陜甘總督“專討”甘肅回民軍

同年7月太平天國天京陷落后大清把鎮(zhèn)壓太平軍清軍抽調(diào)到西北來鎮(zhèn)壓回民起義軍以致“甘省一隅之地而統(tǒng)兵大員專折言事者已至八員之多”兵勇則達(dá)七八萬人

但這些統(tǒng)兵將領(lǐng)派系不一各自為政意見分歧且他們深恐與回民軍硬拚勝敗難保“不如擊之使走捷報頻聞可為幸功邀賞之地”

所以清軍雖曾攻陷回民軍占領(lǐng)固原、鹽茶廳、平?jīng)龅鹊囟鹆x軍實力卻未受到大損失陜西、甘肅回民軍互相配合采用避實趨虛、飄忽靡常游動戰(zhàn)法仍打了不少勝仗

回民起義軍不斷向清軍進(jìn)攻使其文報梗塞糧餉奇絀省城蘭州處于孤立地位清王朝甘肅統(tǒng)治力量處于風(fēng)雨飄搖之中

以致陜甘總督楊岳斌奏折中哀嘆：“現(xiàn)河狄之賊擾于南平固之賊擾于東寧靈之賊擾于北涼肅之賊擾于西幾于剿不勝剿防不勝防臣若株守省垣則饑軍終虞坐困；若出省剿辦則根本時虞動搖外察賦勢內(nèi)度兵力實屬不敷分撥”

同年11月捻軍首領(lǐng)張宗禹按照“前進(jìn)甘陜連結(jié)回眾”以成犄角之勢戰(zhàn)略思想率西捻軍三萬余眾自河南進(jìn)入陜西華陰、渭南境內(nèi)清廷害怕回民軍與西捻軍聯(lián)合急令湘軍援陜

提督劉松山統(tǒng)老湘軍十八營由河南前往一面奏調(diào)防守中衛(wèi)穆圖善部移駐甘陜交界涇州防止回捻合勢一面率三十營清軍從陜西西部隴州、邠州一帶東下專力攻捻

回民軍與西捻軍雖然各自為戰(zhàn)但仍時離時合一定程度上起到了戰(zhàn)略上相互配合作用

甘肅回民軍不斷發(fā)展過程中逐漸形成了四個反清斗爭中心：

一個是馬化龍領(lǐng)導(dǎo)以金積堡為中心包括寧夏府和隴東內(nèi)起義地區(qū)

一個是馬占鰲領(lǐng)導(dǎo)以河州為中心回、撒拉、東鄉(xiāng)族起義地區(qū)

一個是先后由馬文義、馬桂源和馬本源領(lǐng)導(dǎo)以西寧為中心起義地區(qū)

一個是馬文祿領(lǐng)導(dǎo)以肅州為中心起義地區(qū)

隴東董志原則是陜西回民軍根據(jù)地

由于陜甘總督楊岳斌對鎮(zhèn)壓陜甘回民起義束手無策大清調(diào)派閩浙總督左宗棠接任陜甘總督

1867年1月左宗棠從福州取道江西到達(dá)漢口隨即進(jìn)行各項準(zhǔn)備工作2月清廷又授左宗棠為欽差大臣催其迅速北上督辦陜甘軍務(wù)