七月間，鳳翔的回民也集了起來，圍攻府城。
次年二月，甘肅的固原、平涼、寧夏、靈州，均入于新教教主馬化龍之手。
較此稍前，西寧一帶的回民，于馬桂源的鼓動之下，已經把知府與總兵趕走。河州的馬彥龍、馬占鰲則不但占了州城，而且吞并了狄道(臨潭)。甘肅東部的重鎮慶陽與平涼，也成了回眾進攻的目標。
陜甘總督樂斌，對清廷一味蒙蔽，受到查辦，遣戍新疆。經手查辦他的軍機大臣沈兆霖，被任命為署理陜甘總督，在西寧打了幾次小勝仗，于同治元年七月在平番縣二道溝被大水淹死。繼任的熙麟。畏葸不前。清廷派多隆阿以“欽差大臣督辦軍務”的資格去，于同治三年四月死在盩厔城下(對藍朝桂作戰之時)。一個月以后，熙麟免職，由楊岳斌(載福)繼任。楊是水師名將，自知陸戰非其所長，請求開缺，清廷不準，于是回湖南募集新兵十營(五千人左右)，在同治四年六月到任。
這時候，陜、甘兩省原有的綠營軍隊，已無一人可用。各省的所謂援軍，一人未來。多隆阿帶去兩支湘軍：“幫辦軍務”雷正綰的一支，打下平涼與固原以后，于同治四年七月在金積堡被馬化龍擊敗，嘩變；甘肅提督陶茂林的一支，解了鳳翔之圍，打下汧【qian】陽隴州，卻也在同治四年五月間一潰于會寧，九月間再潰于安定(定西)。
嘩變與潰敗的最大原因是欠餉。甘肅早已“庫空如洗”，全靠四川與陜西送來些微的協餉。到了次年春天，當楊岳斌去外縣視師之時，蘭州城的督標(總督所轄的綠營)也鬧了起來，包圍總督衙門，殺害官長，強迫布政使林望向清廷上奏，控訴楊岳斌(厚待)湘軍、歧視綠營。
清廷下旨，將楊岳斌革職留任。楊岳斌藉此稱病辭職，清廷發表左宗棠繼任，于左氏到任以前，暫由穆圖善署理；不久，又加給左宗棠“以欽差大臣，督辦軍務”的名義。
左宗棠首先與各省當局商妥協餉，然后在六年六月到達潼關，調來劉松山的老湘營、郭寶昌的淮軍及其本人的老部下劉典等人的軍隊，與親兵三千多人、水師一千人、黑龍江馬隊一千多人，共有一百個營(五萬人左右)。
然而，左宗棠一時無法以全力消滅反清回民；反之，必須以大部分的力量應付張宗禹的“西捻”。
一個年頭以后，西捻完全消滅，左宗棠再度來陜，才展開對反清回民的猛烈攻勢，同時解決聚眾反清的漢人武裝，如董福祥。董福祥以花馬池(鹽池)為根據地，占了陜北十幾個州縣聚集了十幾萬人，聲勢浩大，正在進攻綏德與榆林。
左宗棠派劉松山去，于十一月間在綏德之西的大小理河與董福祥決戰，大勝；追到靖邊縣東北的鎮靖堡，董福祥投降。左宗棠把董的精銳改編的福字營，歸劉松山指揮。
左宗棠的次一目標，是甘肅東北部的慶陽與慶陽西南的董志原。那里有十八個小首領，都是很厲害的。左宗棠調動雷正綰、黃鼎等人，在同治八年四月輕輕一擊，將他們擊潰。
左宗棠的第三目標，是靈州(靈武)附近的郭家橋。這是殘余的反清陜西回民所聚集的所在。擔負這一方面作戰任務的是劉松山。劉松山旗開得勝，在同治八年八九月間打下了郭家橋，追擊這些陜西回民至吳忠堡。
住在金積堡的馬化龍，于一度反清以后，本已接受署理陜甘總督穆圖善的招撫，見劉松山大軍壓境，便始則出面調解，繼則再度反清，把吳忠堡的陜西回民引進靈州城固守。于是，劉松山又攻靈州；在攻下靈州以后，轉軍進攻金積堡。
攻到同治九年正月，金積堡外圍的寨子已被劉松山攻下很多，剩下一個叫馬五寨的寨子卻很難攻。守寨的人，叫做馬五。劉松山胸部中了一彈．當天氣絕身死。死時，寨子被他的部隊攻下。
劉松山在湘軍將領之中，是佼佼者。曾國藩于打下南京以后，裁了大部分湘軍，只留下他的九千多人未裁。曾國藩認為一般的湘軍“暮氣已深”，惟有他的這一支紀律嚴明，仍堪作戰。
他于咸豐三年二十歲的時候，在家鄉(湖南湘鄉)參加王錱的老湘營，追隨王錱平定湖南南部；在咸豐七年打下湖北的崇陽通山，自領一營(三百多人)；其后，隨王錱在江西作戰，打下廣昌、樂安。
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